Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hps3Q91VB4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps3Q91VB4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms