Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacng5Q8VHW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms