Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ppargc1bQ8VHJ7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms