Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SelenomQ8VHC3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SelenomQ8VHC3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SelenomQ8VHC3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms