Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cbx7Q8VDS3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx7Q8VDS3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cbx7Q8VDS3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms