Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Uhrf1Q8VDF2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1Q8VDF2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1Q8VDF2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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