Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Rdh10Q8VCH7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh10Q8VCH7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Rdh10Q8VCH7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rdh10Q8VCH7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rdh10Q8VCH7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Rdh10Q8VCH7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Rdh10Q8VCH7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Rdh10Q8VCH7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Rdh10Q8VCH7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh10Q8VCH7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh10Q8VCH7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms