Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm4cQ8VCD7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm4cQ8VCD7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms