Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC51

Wrap53, Telomerase Cajal body protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wrap53Q8VC51 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wrap53Q8VC51 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wrap53Q8VC51 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Wrap53Q8VC51 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wrap53Q8VC51 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wrap53Q8VC51 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wrap53Q8VC51 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wrap53Q8VC51 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wrap53Q8VC51 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wrap53Q8VC51 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wrap53Q8VC51 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wrap53Q8VC51 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Wrap53Q8VC51 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Wrap53Q8VC51 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms