Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc9Q8VC31 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc9Q8VC31 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc9Q8VC31 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms