Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc58Q8R3Q6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc58Q8R3Q6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms