Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OptnQ8K3K8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OptnQ8K3K8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OptnQ8K3K8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OptnQ8K3K8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OptnQ8K3K8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OptnQ8K3K8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OptnQ8K3K8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
OptnQ8K3K8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OptnQ8K3K8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OptnQ8K3K8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OptnQ8K3K8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms