Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MyripQ8K3I4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MyripQ8K3I4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms