Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nsl1Q8K305 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nsl1Q8K305 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms