Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccm2Q8K2Y9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccm2Q8K2Y9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccm2Q8K2Y9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms