Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrrdQ8K2M3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SrrdQ8K2M3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrdQ8K2M3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrdQ8K2M3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrrdQ8K2M3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms