Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Glis1Q8K1M4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Glis1Q8K1M4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Glis1Q8K1M4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms