Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FgbQ8K0E8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FgbQ8K0E8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FgbQ8K0E8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
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