Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmbrd1Q8K0B2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmbrd1Q8K0B2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmbrd1Q8K0B2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms