Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rasgef1bQ8JZL7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rasgef1bQ8JZL7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rasgef1bQ8JZL7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rasgef1bQ8JZL7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Rasgef1bQ8JZL7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Rasgef1bQ8JZL7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rasgef1bQ8JZL7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rasgef1bQ8JZL7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rasgef1bQ8JZL7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rasgef1bQ8JZL7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rasgef1bQ8JZL7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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