Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Celf3Q8CIN6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Celf3Q8CIN6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Celf3Q8CIN6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Celf3Q8CIN6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Celf3Q8CIN6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Celf3Q8CIN6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Celf3Q8CIN6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Celf3Q8CIN6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Celf3Q8CIN6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms