Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rftn2Q8CHX7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rftn2Q8CHX7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms