Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rab11fip3Q8CHD8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rab11fip3Q8CHD8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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