Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp2Q8CGR7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp2Q8CGR7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms