Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gpc3Q8CFZ4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpc3Q8CFZ4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms