Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hpf1Q8CFE2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
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