Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF25

UPF0575 protein C19orf67 homolog, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF25 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF25 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF25 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF25 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF25 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF25 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF25 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF25 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF25 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF25 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF25 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF25 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF25 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8CF25 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8CF25 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8CF25 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8CF25 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8CF25 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8CF25 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8CF25 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8CF25 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8CF25 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8CF25 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8CF25 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8CF25 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8CF25 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8CF25 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8CF25 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8CF25 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8CF25 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8CF25 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8CF25 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8CF25 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8CF25 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8CF25 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8CF25 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8CF25 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8CF25 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8CF25 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8CF25 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8CF25 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8CF25 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CF25 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CF25 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CF25 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CF25 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CF25 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CF25 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8CF25 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CF25 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CF25 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CF25 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CF25 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CF25 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CF25 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CF25 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CF25 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CF25 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CF25 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CF25 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CF25 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CF25 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8CF25 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CF25 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CF25 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CF25 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CF25 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CF25 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CF25 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CF25 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms