Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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Rdh13Q8CEE7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh13Q8CEE7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Rdh13Q8CEE7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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Rdh13Q8CEE7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Rdh13Q8CEE7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Rdh13Q8CEE7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Rdh13Q8CEE7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rdh13Q8CEE7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rdh13Q8CEE7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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