Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
9030612E09RikQ8CE20 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
9030612E09RikQ8CE20 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms