Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc87Q8CDL9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc87Q8CDL9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc87Q8CDL9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms