Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc27Q8CD92 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc27Q8CD92 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc27Q8CD92 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms