Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf31Q8CCF0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf31Q8CCF0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf31Q8CCF0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms