Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Apoa5Q8C7G5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Apoa5Q8C7G5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoa5Q8C7G5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa5Q8C7G5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.2 ms