Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc113Q8C5T8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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Ccdc113Q8C5T8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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Ccdc113Q8C5T8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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Ccdc113Q8C5T8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
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