Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccser1Q8C0C4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccser1Q8C0C4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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