Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx22Q8C084 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms