Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strip1Q8C079 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strip1Q8C079 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strip1Q8C079 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strip1Q8C079 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Strip1Q8C079 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Strip1Q8C079 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Strip1Q8C079 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Strip1Q8C079 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Strip1Q8C079 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Strip1Q8C079 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Strip1Q8C079 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms