Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TnrQ8BYI9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TnrQ8BYI9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms