Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam53cQ8BXQ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam53cQ8BXQ8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam53cQ8BXQ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam53cQ8BXQ8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam53cQ8BXQ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam53cQ8BXQ8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam53cQ8BXQ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam53cQ8BXQ8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam53cQ8BXQ8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam53cQ8BXQ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam53cQ8BXQ8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam53cQ8BXQ8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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