Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod1Q8BVA4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod1Q8BVA4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms