Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep55Q8BT07 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep55Q8BT07 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms