Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cc2d1bQ8BRN9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cc2d1bQ8BRN9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cc2d1bQ8BRN9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cc2d1bQ8BRN9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cc2d1bQ8BRN9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cc2d1bQ8BRN9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cc2d1bQ8BRN9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cc2d1bQ8BRN9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms