Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab11fip4Q8BQP8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab11fip4Q8BQP8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms