Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem260Q8BMD6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem260Q8BMD6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms