Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Usp54Q8BL06 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Usp54Q8BL06 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Usp54Q8BL06 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Usp54Q8BL06 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms