Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Susd4Q8BH32 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Susd4Q8BH32 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Susd4Q8BH32 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Susd4Q8BH32 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Susd4Q8BH32 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Susd4Q8BH32 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Susd4Q8BH32 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Susd4Q8BH32 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms