Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH2

Samm50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samm50Q8BGH2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samm50Q8BGH2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samm50Q8BGH2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Samm50Q8BGH2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samm50Q8BGH2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Samm50Q8BGH2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Samm50Q8BGH2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms