Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim6Q8BGE7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms