Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npas4Q8BGD7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npas4Q8BGD7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npas4Q8BGD7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms