Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdspl2Q8BG15 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdspl2Q8BG15 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctdspl2Q8BG15 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctdspl2Q8BG15 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdspl2Q8BG15 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms